新车磨合剂不会有什么危害的：
1、磨合剂是专门针对新车在磨合阶段使用的，可以提高发动机磨合质量，确保发动机磨合效果更佳。新车磨合剂可以有效的稳定汽车初装润滑油的黏度参数，防止发动机中各部件因为其粗糙表面在进行相互磨合时而造成的润滑油黏度下降；
2、磨合是在机器装配后使用前，为了能够有效的使配合件正常稳定运转的一种措施，也称跑合。磨合是汽车厂商一种有意安排的磨损过程。机械零件的磨损过程一般主要包括了磨合阶段、稳定磨损阶段和剧烈磨损阶段。机器在开动以后，磨损率都会从大逐渐减小。这主要是由于摩擦副表面微观凹凸不平，开始工作的时实际接触面积一般都是很小的，而接触应力都是很大的；
3、在磨合的过程中，较软的零件表面材料一般都会发生塑性流动，使接触面积扩大并出现加工硬化层。对于较硬材料，高的微凸体被磨去，表面逐渐变得平坦而使接触面积增加。这些变化使以后的磨损率减小而达到磨合目的。磨合应由轻到重缓慢加载，并保持润滑油的清洁，防止磨屑进入摩擦面而造成剧烈的磨损和发热。磨合结束后应仔细清洗并换用新的润滑油。