1、公司结构和股权占比不同，是两家完全不同的合资企业；2、成立时间不同，一汽大众成立时间要晚于上汽大众；3、旗下拥有的车型不同；4、一汽大众在早期的代表车型是捷达，而上汽大众早期代表车型是桑塔纳。
一汽大众早期是由中国第一汽车股份有限公司与德国大众汽车股份公司合资成立的，一汽占股60%，大众占股40%，后来奥迪汽车股份有限公司入股，股权占比变为一汽占股60%，大众占股30%，奥迪占股10%。上汽大众则是由上汽集团和大众汽车集团合资经营的企业，各占股50%。一汽大众和上汽大众使用同样的VW的logo，但是业务线是完全独立的，就连车型对标的人群也有所差异。