使用自动模式时，风扇转速根据温度设定和环境状况自动进行调节。但风扇不会立即转动，而要等到暖气或冷气准备妥当才会进行送风操作。如果操作风扇转速设定或气流模式，则自动模式指示灯熄灭。在空调有一个旋钮，将旋钮上面的指示标志旋转到红色最大的位置，车内开内循环，水温上来自动出后讲风扇打开，出热风。卡罗拉双擎空调系统最大程度地保证驾乘者的呼吸安全，主要体现在两个方面：一、卡罗拉双擎搭载了带有花粉过滤功能和PM2.5过滤功能的空调，在此基础之上，较高配的车型还搭载了双区自动空调，同级别少有。二、尤其推荐在旗舰版车型上搭载的带有Nanoe纳米水离子的空气净化系统功能，它能够向空气中释放离子杀灭细菌，从而进一步提升乘坐环境的空气质量，确保空气安全。