简单而言，单缸只有一个气缸，结构简单成本低，可是震动和噪音稍大，双缸有两个气缸，平稳性好震动噪音更低，可是价格较高，因此 双缸要比单缸高一个档次。单缸发动机在中低转速下比同排量的双缸发动机爆发力更强，因此在起步和低速状态下，单缸加速好于双缸，可是双缸更易于达到高转速，适合大排量摩托车。同排量的发动机，单缸结构简单，其构成的零部件数量也较少，且不需进行左右汽缸的平衡调整，故障点少；与此同时，简单的结构又决定了单缸机具有制造和装配工艺简单、技术难度小等特点，因此单缸机的制造成本也较低，且使用维护简便，具有非常好的经济性。单缸机的宽度比双缸机窄，有利于实现整车造型的苗条化，并保证足够宽的搁脚位置，保证驾驶员的骑乘舒适；单缸机还使整车重量减轻，因此能保证车辆转向灵活，操纵稳定性好。
双缸的机构相比之下技术性、生产制造就要复杂得多，因为增加了一个汽缸，因此，相应的汽缸、活塞、活塞环、连杆、活塞销等零件数量增加了一倍，此外，像化油器、汽缸盖、曲轴、排气系统等专用零件的结构也比单缸机的更为复杂，这就使得双缸机具有工艺难度大、技术含量高等特点，也决定了双缸机的制造成本远远高于单缸机，且因为零件数量的增加会致使发动机的故障点增多，再加上还需要调整左右缸的平衡，因此其使用和维护也更复杂。