大众凌渡配备了7挡双离合变速器，并且这款变速器提供了手动驾驶模式，除了可以像自动挡一样开，也能偶尔像手动挡一样手动换挡。虽然大众凌渡自动变速器换挡操作简单，但也有一些需要注意的地方。
1.当大众凌渡的换挡杆处于P或N挡时，锁止机构会防止换挡杆直接切换档位导致意外发生，因此在P或N挡切换到其他档位是需要按住档杆上的解锁按钮并踩住刹车。
2.在经过N挡迅速换挡时（如从R切换到D/S），档杆不会被锁止。如果在制动踏板处于未踩下状态超过2秒时和车速低于5km/h时选档杆在N挡，则档杆会被锁止。
3.当档杆第一次挂入D/S挡时，变速器处于D挡，沿着箭头方向向下拨一下，切换到S挡，但档杆会自动跳回D/S位置。每拨一次，档杆会在D挡和S挡之间切换。
4.档杆在D/S挡时，将挡杆向右边拨动切换到手动模式，在手动换挡的模式下，将档杆向前推加档，向后拉减档，并且方向盘处配有拨片的也可以通过拨片控制加减挡。