食用霉变甘蔗中毒多在不知不觉中发生，以3～16岁的少年儿童为多，其次是60岁以上老年人(常为饮用混入霉变甘蔗的甘蔗汁引起)，进食后有2～8小时的潜伏期，最短者为10分钟、长者可达17小时，进食量越大潜伏期越短，临床症状越重，预后也越差。中毒情况有三种：
潜伏期较长，出现恶心、呕吐、腹痛等消化道中毒症状，继之出现纳差、头昏、眼前发黑、视物不清或复视等症状。由于患者进食甘蔗较少，一般在数小时后可恢复。
潜伏期较短，一般在2小时内即出现频繁恶心、呕吐、腹痛，并很快进入中枢抑制性昏睡。若抢救治疗及时极少有后遗症。
潜伏期极短，多在10分钟至1小时左右，患者在频繁恶心、呕吐、剧烈腹痛后很快出现阵发痉挛性抽搐，每次发作在1～2分钟左右，发作时头后仰、牙关紧闭、两眼球偏向一侧、四肢屈曲强直、反复发作，严重者常呈癫痫持续状态。抽搐发作后多陷入昏迷，两侧瞳孔散大、眼球震颤、向上凝视。
甚则在昏迷后出现狂躁、强迫体位或瘫痪，并出现肺水肿、血尿和黑便，最终多死于呼吸衰竭或癫痫持续状态。及时抢救治愈者，可在一周后开始恢复，但恢复过程中常出现意识、运动及语言障碍，甚至遗留种种难以恢复的锥外系统后遗症，如迟发性肌张力障碍，不自主阵发扭曲，痉挛或手足徐动，更为严重者出现去大脑皮质综合征。